Un desafío ecológico es comprender los efectos de la reducción del tamaño corporal en respuesta al cambio climático, un fenómeno que podría alterar significativamente los sistemas agroecológicos. Sin embargo, los efectos de estos cambios en los rasgos individuales y las interacciones tróficas sobre la estructura de las redes alimentarias en dichos sistemas aún no se han explorado en su totalidad. En el hemisferio sur, la importancia socioeconómica y cultural de la agricultura justifica la necesidad de investigar estos sistemas. En este estudio, la planta hospedante seleccionada es la sandía (Citrullus lanatus), la plaga corresponde al pulgón del algodón (Aphis gossypii) y el potencial agente de control biológico es el ácaro depredador chileno (Eriopis chilensis). Para comprender teóricamente la estructura de esta cadena alimentaria, desarrollamos un modelo de tres niveles que incluye el control biológico, dos plagas y la planta hospedante. El modelo combina un sistema dinámico continuo con pulsos discretos que representan los nacimientos y la introducción de nuevos individuos del agente de control. Las respuestas funcionales de tipo II de Holling, las tasas de reproducción y mortalidad y la capacidad de carga dependiente del tamaño corporal de la especie se integran en el modelo. Adicionalmente, se presenta un algoritmo computacional que permite simular el comportamiento del sistema agroecológico. Esta propuesta ofrece una herramienta teórica para mejorar la comprensión de las interacciones entre especies y anticipar dinámicas que podrían ser útiles en el diseño de estrategias de manejo y control agroecológico.